Analyse de coupes histologiques de la peau

Dans le cadre d’un projet de développement logiciel avec la société L’Oréal, une application d’analyse de coupes histologiques de peau par traitement d’image a été développée en collaboration avec le département Evaluation Prédictive de la société L’Oréal et le Centre de Morphologie Mathématique de MINES ParisTech.

 

Cette application permet de :

• charger une image générée par un lecteur de lames Hamamatsu NanoZoomer
• extraire les différentes coupes dans l’image (lame numérisée)
• éliminer certaines zones de l’analyse (détectées automatiquement et/ou définies manuellement par l’opérateur)
• détecter automatiquement les interfaces lumière/stratum corneum/épiderme vivant/derme et la mélanine
• éditer les détections litigieuses
• calculer les mesures morphologiques des couches/interfaces et quantifier la mélanine
• générer un rapport d’analyse

 

Détection des différentes interfaces inter-couches et de la mélanine

Des techniques de traitement d’image classique ont été initialement mises en œuvre afin de détecter les interfaces lumière/stratum corneum, stratum corneum/épiderme vivant et épiderme vivant/couche basale. Cependant, grâce à l’émergence des techniques de Deep Learning, couplées au traitement d’image classique, il est maintenant possible d’atteindre des résultats comparables à ceux obtenus par des experts et, contrairement aux détections manuelles des experts, totalement reproductibles.

 

Les techniques de Deep Learning ont également l’avantage de s’adapter à la variabilité des données à analyser (différents types d’échantillons et différentes colorations) grâce à un réapprentissage effectué par des experts.