Modules 3D : afficher, traiter et analyser en 3 dimensions
Télécharger la fiche produitLes utilisateurs d’Aphelion™ peuvent maintenant traiter et visualiser des images tridimensionnelles grâce à deux modules optionnels de même fonctionnalité et puissance de calcul que leurs équivalents en 2D. En effet, la gamme de produits Aphelion a été récemment enrichie de deux modules capables de traiter des images tridimensionnelles (3D Image Processing) et de les afficher (3D Image Display). L’utilisation de ces deux modules dans l’environnement Aphelion permet ainsi de traiter des images acquises par un microscope électronique à transmission, un microscope confocal, un scanner médical, ou tout autre système d’acquisition 3D. Les images acquises, parfois de grande taille, peuvent ainsi être traitées, analysées et affichées depuis l’interface utilisateur du logiciel.
Module 3D Image Display
Partant des fonctionnalités multiples déjà existantes pour l’affichage d’images 2D dans Aphelion Developer, de nouvelles possibilités ont été ajoutées afin de pouvoir visualiser dans le même environnement des images 3D. Les trois images ci-dessous illustrent les différents modes de visualisation disponibles dans le module d’affichage 3D. Le module conserve le même aspect que l’interface standard de la version 2D du logiciel. Les utilisateurs ayant des projets de recherche en imagerie 3D ou des applications nécessitant le traitement d’images tridimensionnelles trouveront que les outils mis à leur disposition dans le module 3D leur permettent de rapidement prototyper leurs algorithmes en affichant en quasi temps réel les images intermédiaires en cours de traitement. Attention, pour pouvoir fonctionner, le module nécessite l’installation du module 3D Image Processing.
Le module 3D Image Display inclut également l’enregistreur AVI® (Aphelion AVI® Creator) qui permet d’enregistrer des animations dans lesquelles chaque image correspond à une modification de l’objet 3D, comme la rotation, la position ou l’intensité de la lampe, le mode de visualisation, etc.
Ces animations peuvent être sauvegardées comme fichier AVI ou comme une série d’images au format TIFF®, JPEG® ou bitmap afin d’être facilement importées dans des pages web ou des présentations Microsoft Powerpoint.
Image gracieusement fournie par le Synchrotron de l’ESRF (Grenoble). Collaboration entre le GEMPPM (INSA, Lyon) et le Centre de Morphologie Mathématique (Fontainebleau).
Ajouter de l’affichage d’images 3D dans votre application est vraiment facile grâce au module Aphelion 3D Image Display. Ce module est disponible sous forme d’un composant ActiveX® ayant les fonctionnalités suivantes :
- Affichage d’objets 3D comme une série de coupes 2D, un objet composite 3D ou une isosurface
- Contrôle des sources lumineuses et des angles de visualisation
- Contrôle du contexte d’affichage (intensité, zoom, etc.)
- Affichage des sections dans les directions X, Y et Z
- Contrôle des tables de couleurs et des intensités lumineuses
- Contrôle avec la souris ou le clavier des six degrés de liberté
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| Image 3D de betterave affichée en mode isosurface. Image fournie par l’INRA POI, Nantes | Image 3D de cellules affichée en mode composite. Image fournie par le GRECAN (bioticla), Caen | Simulation 3D visualisée en mode composite avec découpage |
Module 3D Image Processing
Partant du module de traitement d’images 2D du logiciel Aphelion, la majorité des opérateurs a été portée dans l’environnement 3D afin de pouvoir traiter et analyser les images tridimensionnelles. Par exemple, la convolution, l’addition, la soustraction, le maximum, l’érosion, la dilatation, la fonction distance, l’étiquettage, les bassins versants, le seuillage et encore bien d’autres opérateurs sont maintenant disponibles dans l’espace 3D. Le module inclut également des mesures 3D et supporte les Objectsets 3D.
Liste des opérateurs disponibles dans le module Aphelion 3D Image Processing and Analysis
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Analyse ImgArea ImgAutoCorrelate ImgBandHistogram ImgBoundingBox ImgCompare ImgCorrelateWithTemplate ImgCountObjects ImgCrossCorrelate ImgFirstPoint ImgHistogram ImgLocalVariance ImgMoments ImgProfile ImgRange ImgTrace ImgVolume ObjAttributeRatio ObjHistogram ObjMoments ObjShape (Volume, Surface, Intercepts, Compactness, Sphericity) RegionStatistics Arithmétique/Logique ImgAbs ImgACos ImgAdd ImgAddConstant ImgAnd ImgASin ImgATan ImgBitAnd ImgBitDifference ImgBitNot ImgBitOr ImgBitXNor ImgBitXOr ImgBlend ImgCos ImgDivide ImgExp ImgExp10 ImgInvert ImgLeftShift ImgLog ImgLog10 ImgLogicalDifference ImgMask ImgMaximum ImgMinimum |
ImgMultiply ImgMultiplyConstant ImgNAnd ImgNOr ImgNot ImgOr ImgRemainder ImgRightShift ImgSin ImgSqr ImgSqrt ImgSubtract ImgSubtractConstFloor ImgTan ImgXNOr ImgXOr Détection de contours ImgExternalGradient ImgInternalGradient ImgLaplacian ImgMorphGradient Filtrage ImgBoxFilter ImgConvolve ImgGaussianFilter ImgHighPass3x3 ImgHighPass5x5 ImgHighPass7x7 ImgLaplacian ImgLaplacian3x3 ImgLaplacian5x5 ImgLaplacian7x7 ImgLowPass3x3 ImgLowPass5x5 ImgLowPass7x7 ImgMedian ImgMedian3x3 ImgMedian5x5 ImgMode ImgMode3x3 ImgRankValueFilter ImgWallisFilter Domaine Fréquentiel ImgFFT ImgInverseFFT Utilitaires d’images ImgClear ImgClip ImgCopy |
ImgCreateGaussianNoise ImgCreateUniformNoise ImgCut ImgEqualizeHistogram ImgFill ImgFrame ImgFree ImgFreeAll ImgImport ImgLinearScale ImgMapThroughLUT ImgMultipleSubCopy ImgPaste ImgRead ImgReadSlices ImgSetName ImgSetType ImgSubCopy ImgWrite ImgWriteSlices Morphologie Mathématique ImgAddReconsClose ImgAlternateSequential ImgAreaClose ImgAreaOpen ImgAutoMedian ImgBorderKill ImgBorderKillAndHoleFill ImgCatchmentBasins ImgClose ImgConstrainedCatchmentBasins ImgConstrainedWatershed ImgDilate ImgDilateReconsClose ImgErode ImgErodeReconsOpen ImgEuclideanDistance ImgExtendedRegionalMaxima ImgExtendedRegionalMinima ImgGeodesicDilate ImgGeodesicGraphDistance ImgGraphDistance ImgHoleFill ImgLocalMaxima ImgLocalMinima ImgMorphContrast ImgOpen ImgOpenSkeleton ImgReconstruct ImgRegionalMaxima ImgRegionalMinima ImgSubtractReconsOpen | >
ImgUltimateErodedSet ImgWatershed Traitement d’objet RegionClose RegionDilate RegionErode RegionOpen RegionOverlap Utilitaires objet ObjAppend ObjCopy ObjDeleteAttribute ObjExport ObjFilter ObjFree ObjFree ObjFreeAll ObjImport ObjMerge ObjRead ObjSpatialAttributeToImage ObjWrite Segmentation ImgAdaptivePercentileThreshold ImgBlackTophat ImgClustersObj ImgClustersSplitConvex ImgClustersToLabels ImgEntropyThreshold ImgEntropyThresholdObj ImgExtremaThreshold ImgHysteresisThreshold ImgHysteresisThresholdObj ImgLabelsObj ImgMomentThreshold ImgMomentThresholdObj ImgRegionGrow ImgRegionGrowObj ImgSeededRegionGrow ImgThreshold ImgThresholdObj ImgWhiteTophat Transforms ImgColorCompose ImgColorToRGB ImgScale |
Films de démonstration
- 3D image display (106 Mo)
- 3D image processing (115 Mo)
