Laboratoires

De nombreux laboratoires dans le monde entier ont retenu Aphelion® comme leur plateforme préférée pour développer des applications en analyse d'images et quantification. Les utilisateurs de ces laboratoires apprécient à leur juste valeur les capacités du logiciel comme :

Voici plusieurs exemples d'applications dans le domaine de l'analyse d'images et plus particulièment la microscopie qui illustrent la puissance et la souplesse du logiciel Aphelion® :

Exemple 1 : Science des matériaux
Equipement : Microscope optique avec caméra digitale
Application : Taille de grains

Dans cette application, le logiciel Aphelion® contrôle la caméra montée sur un microscope optique, affiche les images provenant de la caméra et en cours de traitement, et finalement contrôle le déplacement de la platine motorisée. Aphelion® réalise également le calibrage des mesures après que l'utilisateur ait défini la taille des pixels de l'image dans les directions X et Y.

L'extraction des grains est ensuite réalisée de manière automatique par Aphelion® en utilisant des techniques de segmentation disponibles dans le logiciel. Après la phase de segmentation, les utilisateurs peuvent utiliser l'éditeur d'images binaires ApxEditor afin d'annoter l'image et améliorer le résultat de la détection. Finalement, les mesures comme la distribution en taille et la longueur des frontières sont calculées et corrigées des effets de bord de champ. Des mesures selon les normes ASTM sont également calculées en utilisant les nombres d'intercepts.

Image originale
Image originale
Skiz
Skiz
Image finale
Image finale
Grille
Grille

Example 2 : Biologie et Anatomo-Pathologie
Equipement : microscope optique équipé d'une platine motoriée multi-lames, d'une caméra vidéo et d'une carte d'acquisition
Application : Détection des immuno-marqueurs

Dans cette application, le logiciel Aphelion® contrôle la caméra et la platine motorisée dans les directions X, Y et Z. L'utilisateur définit préalablement la zone à analyser, puis le logiciel balaie automatiquement la zone et effectue de simples acquisitions. Si nécessaire, plusieurs zones peuvent être définies avec recouvrement des champs. Dans le cas où la platine ne serait pas motorisée, il est demandé à l'utilisateur de la déplacer manuellement puis d'utiliser le module optionnel "Image Montage" afin de reconstruire automatiquement une grande image à partir des petites imagettes.

L'analyse inclut la détection des marqueurs (cellules brunes), la mesure de taille, le comptage et le pourcentage de cellules marquées par rapport à la population totale de cellules. A l'origine, la macro avait été développée sur un nombre fini d'images de test, par la suite, elle a été modifiée et validée sur des milliers d'images. C'est maintenant une application qui tourne en routine dans plusieurs laboratoires à l'échelle mondiale.

Original image
Image originale
Cell detection
Détection des cellules
Size distribution
Distribution en taille

Exemple 3 : Tous domaines
Equipement : Dépendant de l'application
Application : Développement d'algorithmes d'analyse d'images à l'aide du logiciel Aphelion®

Un ensemble d'images JPEG est acquis en utilisant Aphelion® ou un autre logiciel. Toutes les images sont ensuite sauvegardées dans une base de données sur le disque dur du PC. Cet ensemble d'images est finalement utilisé pour développer et valider l'algorithme.

Depuis l'interface utilisateur, les fonctions de traitement les mieux appropriées à la résolution de l'application sont choisies. Les paramètres associés à chaque fonction sont modifiés et ajustés afin d'optimiser la détection. Toutes les fonctions retenues sont automatiquement enregistrées dans une macro, les mesures s'affichent à l'écran, et si on le souhaite, sont exportées vers Microsoft Excel.

Une fois la macro développée et testée, elle est exécutée sur toutes les images après avoir ajouté une boucle balayant toutes les images de la base de données. Si besoin est, la macro peut être rendue interactive afin de laisser la possibilité à l'utilisateur d'ajuster les paramètres de certaines fonctions comme un seuillage. Cette macro peut ensuite être lancée depuis l'interface ou bien être convertie en programme autonome Visual Basic, Delphi ou Visual C++ appelant les composants ActiveX d'Aphelion®, depuis une interface dédiée spécialement conçue pour être utilisée par des personnes non expertes en traitement et analyse d'images.

Original image
Microscope électronique à balayage
Cell detection
Microscope optique