Análisis de cometas

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Comet Assay Screenshot

Software para la automatización de la prueba del cometa sobre un gel de electroforesis.

La prueba del cometa, también conocida como electroforesis Alcalina de Células Individuales (SCG: Single Cell Gel Electrophoresis Assay), es una prueba que evalúa el daño del material genético causado por diferentes agentes químicos y físicos. El daño es representado por un aumento de fragmentos del ADN que migran fuera de las células del núcleo bajo una forma característica similar a la cola de un cometa; estos fragmentos son generados por rompimientos del ADN. El ensayo del cometa sobre condiciones alcalinas, fue introducido por Sing y colaboradores en 1988, es útil para la detección rápida de rompimientos de cadenas simples de DNA y de lesiones sitios lábiles al álcali, entrecruzamientos del ADN (crosslinking) y en sitios de reparación del ADN por escisión en células "in vivo" e "in vitro" en muestras celulares muy pequeñas. Es una técnica electroforética sensible, reproducible, simple y de gran utilidad en monitoreo en poblaciones humanas expuestas a radiaciones y a diversas sustancias mutagénicas. Esta prueba es ampliamente utilizada en disciplinas científicas como la toxicología genética, el bio-monitoreo ambiental, la investigación clínica y la epidemiología molecular. Asimismo, es importante resaltar que numerosos laboratorios en el mundo entero utilizan técnicas de procesamiento de imágenes para analizar los cometas, por ejemplo, prestigiosos centros de investigación franceses como la "Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments" o la "International Agency for Research on Cancer" utilizan el software de análisis de cometas desarrollado por ADCIS.

El software posee una interfase usuario muy intuitiva y amigable, con capacidad de exportar las medidas a una hoja de cálculo (spreadsheet) Excel. La aplicación es capaz de segmentar automáticamente las imágenes, de analizar el núcleo y la forma de la cola y de discriminar automáticamente entre células normales, deterioradas y fuertemente deterioradas. Muy pocos parámetros deben ser definidos antes del procesamiento de un lote de imágenes.

El producto incluye:

  • La detección de la cola y la cabeza del cometa.
  • La detección de células apoptóticas (células en proceso de apoptosis o muerte celular programada).
  • El computo de medidas estadísticas para el cometa y la apoptosis.
  • El cálculo del momento de la cola del cometa.

Principales ventajas de la aplicación:

  • Configurable (orientación, la sensibilidad de detección, las opciones de visualización)
  • Detección automática de cometas
  • Cálculo automático de las medidas
    CometExtent, CometTotalIntensity, CometTotalArea, TailExtent, TailExtentMoment, TailOliveMoment, TailIntegratedIntensity, TailIntensityRatio, TailArea, TailBreaksNumber
  • Lote

Es actualmente el único software capaz de detectar células considerablemente deterioradas. El análisis es independiente del campo eléctrico inicial. El usuario puede eliminar el ruido de fondo y discriminar las células que se tocan entre ellas. Todas las medidas son calibradas y toman en cuenta el tamaño de los píxeles así como el sesgo inducido por captores no-cuadrados. Es posible clasificar las células en diferentes categorías y exportar las medidas asociadas a Microsoft Excel®. La imagen resultante del análisis mostrando la cabeza y la cola del cometa, tal como es detectada por el software, es visualizada en pantalla. Esto permite entre otros de verificar rápidamente los resultados.

El software fue desarrollado en colaboración con el "Centre de Lutte contre le Cancer F. Baclesse" y el "Groupe de Recherche en Informatique, Image, et Instrumentation de Caen (GREYC)". El puede, si es necesario, ser adaptado a imágenes adquiridas en condiciones ligeramente diferentes.